手術目的是把鼻腔及鼻竇內的阻塞清除，促進鼻分泌物的流動及排除。 手術可透過內視鏡治療發炎位置，按情況，耳鼻喉醫生會為患者進行局部麻醉或全身麻醉。通過內視鏡的監察，在鼻腔內進行手術，故此面上及鼻子外面均不會有傷口或留下疤痕。
另外，在鼻竇內視鏡手術過程中，亦可即時進行其他手術，包括鼻中隔成型術或鼻息肉切除術。
鼻竇炎手術後
手術後，患者的鼻腔內會放入敷料，並於一至兩天後由醫生取出。所以患者於手術後頭兩天需要休息。患者會出現鼻子阻塞和不適的感覺，耳鼻喉醫生會處方藥物以控制不適感。於手術後初期，患者需每天以生理鹽水清洗鼻腔，以減少感染。患者亦要依時覆診，讓耳鼻喉醫生清潔及護理傷口，確保傷口癒合良好。
內視鏡手術會有可能出現併發症，如出血、發炎等。
